他的丈夫，是石柱宣抚使马千乘，汉朝伏波将军马援之后。在她丈夫死后，由她代行宣抚使职务，宣抚司相当于一个土司自治区。

万历二十七年（1599年，杨应龙在播州作乱，秦良玉的丈夫石柱宣抚使马千乘率领三千人随李化龙前往征讨，十六岁的秦良玉首次踏上战场，开始了他传奇的戎马一生。

是她提议马千乘编练兵丁，说现在天下动乱，正该领军报国，建功立业，马千乘觉得有理，于是便有了赫赫有名的白杆兵。

她先后参与平定杨应龙之乱的多场战斗，为战功第一。

泰昌元年，辽东经略熊廷弼觉得辽兵孱弱，不断向朝廷请调兵力，其中就点了秦良玉的白杆兵。

朝廷诏令秦良玉出兵援助。秦良玉帅兵驻守山海关，派兄长秦邦屏，弟弟秦民屏率领几千人先行前往辽东。

熊廷弼对川军评价颇高，称赞其“川军心力颇齐而皆徒步”，但是对浙兵评价却并不高，称“南兵虗而猾，这批浙兵为新募之兵，尚未经过训练，后调戚金与张名世二人主持浙兵训练。

令人没想到的是，经过几个老戚家军的训练，浙兵在浑河爆发出了惊人的战斗力。

在浑河之战后，在当晚突围而出的川军有两千三百多人，浙兵则不足百人，朝廷体恤他们，允许他们回去修整，他们却坚持留在辽东，要继续为国效力，并为死去的浙兵兄弟报仇。

后来这几十人全部战死于辽阳之战，令人惋惜的是，也正是因此他们未能将戚家军的真传留存下来。又或者，正是他们得到了戚家军的真传，才都从一些油滑的青年，变成了不畏生死的战士，若回去了，也许就是没有得到真传呢！这就是历史的遗憾吧！

在川兵刚到时，朝廷赐了秦良玉三品官员的服饰，并任命秦邦屏为都司佥书，秦民屏为守备。