12月16日(鬼子占领第2天):位于南京安全区内的华侨招待所中躲避的中国男女难民5余人被鬼子集体押往中山码头，双手反绑，排列成行。

鬼子用机枪射杀后，弃尸于长江以毁尸灭迹。

5多人中仅白增荣、梁廷芳二人于中弹负伤后泅至对岸，得免于死。

鬼子在四条巷屠杀4余人，在阴阳营屠杀1多人。

12月17日(鬼子占领第4天):中国平民3余人被鬼子押至煤炭港下游江边集体射杀。在放生寺、慈幼院避难的4余中国难民被集体射杀。

12月18日(鬼子占领的第5天)夜，下关草鞋峡。

鬼子将从南京城内逃出被拘囚于幕府山的中国难民男女老幼共57418人，除少数已被饿死或打死，全部用铅丝捆扎，驱集到下关草鞋峡，用机枪密集扫射，并对倒卧血泊中尚能shen吟挣扎者以乱刀砍戮。

事后将所有尸骸浇以煤油焚化，以毁尸灭迹。此次屠杀仅有伍长德一人被焚未死，得以逃生。

大方巷难民区内鬼子射杀4余人。

成千上万的妇女被强奸，鬼子不分昼夜并在受害妇女的家人面前施行强暴。有些妇女被鬼子强奸了好几次，往往有妇女受不住鬼子的折磨而死。除此之外，鬼子还强迫luan伦行为。估计当时发生的强暴案可能超过2宗。

鬼子在南京进行了长达6个星期的大屠杀，中国军民被枪杀和活埋者达3多万人。

中华民族在经历这场血泪劫难的同时，中国文化珍品也遭到了大掠夺。

据说，儿玉誉义夫还没进南京城，他所抢来的金银财宝因为太重，竟把一架飞往日本的军用飞机给压塌了，从此他改为只收红宝石、蓝宝石及古书画，以便于运回本国。

1938年春，日本从国内调集了多达1人的各方面专家、学者来到南京城。