有部分人想打道回府，更多的人却想夺回塞浦路斯岛，毕竟空手回去，威尼斯妥协的条件可不会兑现。

恰好此时，联军舰队得知在亚得里亚海活动的阿里帕夏率领的舰队正停泊于勒班陀港口，众人立即驶向勒班陀海域寻找战机，勒班托海战由此展开。

海战从157年1月封锁勒班陀港开始，真正开打是在1571年1月7日。

联军舰队约有23艘主力战舰，统辖8万名（另说是5万名包括士兵和水手在内的海上人员，指挥官是来自奥地利年纪24岁的唐·胡安。

唐·胡安是西班牙国王查理五世和芭芭拉·布隆伯格的私生子，现任国王费利佩二世的异母弟。刚出生时，就交给了一个巴塞罗那贵族抚养。父子两人相认后，唐·胡安在西班牙王宫中与同龄的侄子唐·卡洛斯和外甥亚历山大·法尔内塞一起接受教育。1568年，唐·胡安便率领一支分舰队征剿巴巴里海盗，也算出身行伍。

而对手，奥斯曼舰队约有25艘战舰以及9万名左右的海上人员，在数量上占据优势。但指挥官阿里帕夏出身低微，凭借陆上的战功和素丹的提携才爬到第四位维吉尔的高位。他在勒班托海战前未指挥过任何一场海战，毫无海战经验。之所以能担任奥斯曼海军司令，完全得益于奥斯曼宫廷派系斗争，阿里帕夏对赛里姆二世惟命是从，是绝对忠诚的将领。

不仅如此，奥斯曼舰队内部还分为了海盗派与官员派，两派相互看不顺眼，简直祸不单行。