顺治十年受命经略湖广、广东、广西、云南、贵州等处，总督军务兼理粮饷。

顺治十六年督清军攻占云南后回都城。

崇祯十一年九月，清军两路南下，京师戒严。

两面受敌的明朝不得不从西线把主帅洪承畴调来，与孙传庭率军入卫。

第二年秋，皇太极领兵攻占义州，以此为基地，展开对锦州的围攻战。崇祯帝也极力加强对山海关和锦州的防守。

崇祯十二年初，洪承畴调任蓟辽总督，领陕西兵东来，与山海关马科、宁远吴三桂两镇合兵。锦州有松山、杏山、塔山三城，相为犄角。

崇祯十三年冬，清军攻锦州及宁远，洪承畴派兵出援，败于塔山、杏山。

崇祯十四年春，为挽救辽东危局，明廷遣洪承畴率宣府总兵杨国柱、大同总兵王朴、密云总兵唐通、蓟州总兵白广恩、玉田总兵曹变蛟、山海关总兵马科、前屯卫总兵王廷臣、宁远总兵吴三桂等所谓八总兵兵马，领精锐十三万、马四万来援，集结宁远，与清兵会战。